每個人的DNA遺傳物質都是一半來自母親，一半來自父親；因此孩子的一對等位基因也就是一個來自母親，一個來自父親。如果對多對等位基因進行檢測，鑒定結果如果全部符合這一規律，則表明具有生物學意義上的親子關系；若不符合這一規律，則排除親生關系(變異情況除外)。在大多數的情況下，母、子關系是已知的，要求鑒定假設父和孩子是否具有親生關系。此時只要對比孩子與假設父的基因型，如果每一對等位基因中孩子與假設父都出現相同的基因型，則可以認定具有親子關系。如果等位基因中孩子與假設父出現兩對或兩對以上的不匹配的基因型，則可排除假設父與孩子的親生關系。通常通過13對、15對甚至更多對這樣的STR基因位點檢測，可以達到認定是否具有生物學意義上的親子關系。
DNA親子鑒定目前在社會上已經是一項很成熟的技術了，DNA親子鑒定是目前最準確的親權鑒定方法，在單親的DNA親子鑒定中，如果小孩的遺傳位點和被測試男子的位點有3個以上包括3個的基因位點不一致，那么該男子便100%被排除血緣關系之外，即他絕對不可能是孩子的父親。如果孩子與其父母親的位點都吻合，我們就能得出親權關系大于99.99%的可能性，即證明他們之間的血緣親子關系，如果出現兩個或一個基因位點不一致的話，就可能出現了百分之1.4基因突變的情況，那時就需要補充母親的樣本再進行驗證了。
一、DNA親子鑒定的原理
通俗地講，一個個體的DNA從父母處獲得，而且也只能從父母處獲得，其中父母的機會均等，父親將自己的DNA奉獻給孩子一半，母親也給了一半，孩子各帶有父母一半的DIA，孩子不可能帶有父母沒有的DNA，這是基本的遺傳規律。DNA鑒定就是根據這種遺傳規律，對父親、母親、孩子的DNA進行檢測，如果發現孩子帶有父親或者母親沒有的DNA，則可以排除親子關系，如果經檢測孩子確實帶有一半父親、一半母親的DNA，然后再進行一些統計學方面的計算，以排除大規模人群中非父母子關系偶然出現的DNA一致的情況，最終確定父母子關系。
二、DNA親子鑒定的樣本檢測步驟
這里我們選擇毛細管電泳儀和熒光標記試劑盒檢測進行介紹。從獲得樣本以后開始，常規樣本的檢測步驟如下：
第一步:DNA提取
就是把樣本細胞核中所含有的DNA提取出來，然后進行一定的純化，去除樣本中的雜質。
第二步:PCR擴增
PCR的中文名為聚合酶鏈式反應，簡單的說，PCR擴增這一步就是把我們所需要的片段通過酶促反應，放大到通過某些專用儀器可以看到的程度。
第三步:后PCR反應
這一步主要是上測序儀檢測的準備階段，將雙鏈的DNA打開，加一些檢測用的的內標，主要是用來標記檢測的片段長度。
第四步：毛細管測序儀檢測
由于DNA帶有電荷，通過毛細管電泳的方法，不同片段DNA長度的電泳速度不同，在同樣的電壓，同樣的電泳時間下，泳動的距離不同，這些長短不同的距離可以通過前期加入的內標測量分辨出來，同時可通過一定的軟件顯示在電腦上，方便檢測人員處理和分析數據。
第五步：分析數據，出具報告
主要是檢測人員將所得結果進行分析匯總、計算，然后出鑒定結論和報告。DNA鑒定中心司法鑒定所的專家告訴我們，上面的步驟為常規樣本(血液、血痕、口腔拭子、帶毛囊的毛發)的常規檢測步驟，不包含一些特殊樣本的前期處理。比如骨骼、牙齒、精斑、混合斑等樣本，還需要一個復雜的前期處理過程，有的還需要二次消化，比常規檢測的步驟要多很多，而且操作相對精細和麻煩。
